Команда исследователей из Университета Тель-Авива разработала автоматическую вычислительную систему, помогающую идентифицировать мутации в геномах раковых клеток. Ученые надеются, что в будущем ее смогут использовать в персонализированной медицине, разработке лекарств и диагностике. Она также потенциально будет полезна при предварительной оценке эффективности того или иного вида противораковой терапии для определенных групп пациентов.
Тамир Таллер, курировавший проект, пояснил, что технология автоматически расшифровывает геномы и находит раковые мутации, которые до сих пор не могли быть интерпретированы человеческим мозгом. В частности, технология может расшифровывать и моделировать мутации, которые влияют на регуляцию экспрессии генов, а не только на структуру белка.
«Если мы будем знать механизм действия каждой новой мутации, то сможем лечить каждый тип рака», - говорит Таллер. – Упрощенно рак классифицируется на разные типы, но каждый тип может содержать сотни подгрупп. И из-за специфических мутаций они могут вести себя совершенно по-разному. Кроме этого, опухолевые клетки постоянно развиваются, улучшая собственную выживаемость и устойчивость к лечению».
Пытаясь решить эту проблему, команда Таллера использовала искусственный интеллект для создания системы, которая бы эффективно сканировала и распознавала раковые геномы. Также она применяет компьютерное моделирование внутриклеточных процессов для понимания воздействия мутаций на раковые клетки.
Уже просканированы тысячи геномов, и обнаружено столько же новых мутаций. В будущем эта информация будет полезна для определения того, какие методы или лекарства лучше всего подходят для лечения определенных видов рака и определенных групп пациентов. С ее помощью также можно будет спрогнозировать вероятность успеха противоопухолевой терапии.
«Как правило, врачи, изучающие эти новые мутации, не имеют ни малейшего представления о том, на что они влияют и какое могут иметь отношение к лечению», - поясняет Таллер. – «Но во многих случаях генные мутации очень важны, и игнорировать их – это означает упускать из виду информацию, которая имеет большое значение для успешного лечения рака».
В данный момент исследовательская группа пытается основать небольшую коммерческую компанию, чтобы с ее помощью распространять программу среди врачей и других медицинских работников, которым она будет полезна.
